IFCD007PO BIOINFORMÁTICA APLICADA AL DESARROLLO DE MEDICAMENTOS

SCORM 1. INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA.

Intentando definir la bioinformática.

Relevancia actual de la bioinformática.

Formatos de ficheros y bases de datos.

Proveedores institucionales de datos.

Herramientas locales y de internet.

SCORM 2. HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES.

Sistemas operativos alternativos: introducción a Unix/Linux.

Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes).

Lenguajes de programación: Perl como ejemplo.

Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl.

Herramientas estadísticas: R como ejemplo.

Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo.

Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo.

Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos.

SCORM 3. ALGORITMOS.

Búsqueda de patrones en secuencias.

Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica.

Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal.

SCORM 4. BIOINFORMÁTICA APLICADA.

Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST).

Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones).

Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR).

Minería en datos masivos (high throughput screening).

Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO).

Análisis de la variación (polimorfismos).

Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias).

Biología estructural tridimensional: PDB.